Gerade habe ich mich dem Thema nochmals angenommen. Folgendes funktioniert soweit ich es testen konnte. Ist jedoch mit Vorsicht zu genießen.
1. Tabelle t_eo_ENTITÄTENNAME löschen
2. in Tabelle t_md_entity_field Verweiße auf t_md_entity Einträge der „Werteliste“ (Entität) löschen
3. Zeile in t_md_entity des Eintrags löschen
4. Dienst neustarten
Danach konnte ich ohne Probleme die Werteliste wieder anlegen und mit Werten füllen